Największą siłą telefonu Apple jest liczba i różnorodność dostępnych aplikacji. Aby móc zaoferować swoje oprogramowanie posiadaczom iPhone, musi ono przejść pozytywną weryfikację, która ma zapewnić, że w App Store znajdą się tylko bezpieczne produkty. Coraz częściej mówi się jednak, że proces ich zatwierdzania jest niejasny, a wynik niepewny, nawet przy bardzo dopracowanych aplikacjach. Opinie te potwierdza chociażby ostatnie odrzucenie programu zespołu Nine Inch Nails – prawdopodobnie dlatego, że pozwala na odsłuchanie piosenki zawierającej pojedyncze „brzydkie słowo”.